Biotecnologie per la Medicina Molecolare - 40 Ciclo

Il campo della glicoprotemica ha fatto enormi progressi negli ultimi anni e promette di fornire significativi contributi nel campo dei marcatori tumorali. Fino a poco tempo fa, l'analisi dei glicani e la caratterizzazione dei siti di glicosilazione sulle proteine erano due approcci paralleli che si basavano su metodologie diverse. Oggi, l'analisi diretta dei glicopeptidi intatti è resa possibile dai progressi fatti nel campo della strumentazione analitica, in particolare nella spettrometria di massa (MS) e nel campo dell'analisi dei dati MS. 

Il candidato svilupperà protocolli per l'arricchimento di glicopeptidi su biglie magnetiche (biossido di titanio, cromatografia a interazione idrofila, funzionalizzazione con acido boronico) e per l'analisi MS dei glicopeptidi in modalità data-independent acquisition (DIA). Questa ultima modalità di scansione ha prodotto enormi progressi nella proteomica “whole cell” nell'ultimo decennio ed ha un potenziale ancora largamente inesplorato in glicoprotemica. I nuovi protocolli sviluppati dal candidato per la glicoprotemica saranno applicati all'analisi dei glicopeptidi di un set di campioni di interesse nel campo dell'oncologia (fluido biologico o tessuto tumorale).