Analisi delle reti trascrizionali guidate dalla metilazione del DNA nel carcinoma del colon e del retto
Biotecnologie Per La Medicina Molecolare - 41 Ciclo
Gianluca Santamaria
Simona Severini
L’adenocarcinoma del colon (COAD) e del retto (READ) condividano molte caratteristiche cliniche, evidenze emergenti mettono in luce profili molecolari ed epigenetici distinti tra questi sottotipi tumorali. La metilazione del DNA, una modifica epigenetica fondamentale, regola l’espressione genica e la struttura della cromatina, e la sua alterazione rappresenta una caratteristica tipica del cancro. Le differenze nella metilazione a livello di elementi cis-regolatori chiave, come gli enhancer e i promotori, possono influenzare profondamente la biologia tumorale e la prognosi dei pazienti. Tuttavia, gli effetti a valle di queste differenze di
metilazione sulle reti di fattori di trascrizione e sulla regolazione genica specifica dei sottotipi tumorali sono ancora in gran parte inesplorati. Questo progetto si propone di colmare questa importante lacuna conoscitiva studiando come la metilazione del DNA influenzi le reti regolatorie trascrizionali nel COAD e READ. Attraverso analisi integrative di dati genomici di metilazione ed espressione genica, accompagnate da validazioni sperimentali, lo studio identificherà i principali fattori di trascrizione regolati dalla metilazione e ne chiarirà il ruolo nell’eterogeneità tumorale e nella progressione della malattia. Questo progetto fornirà approfondimenti meccanicistici sull’epigenetica del CRC, distinguendo le peculiarità molecolari nel COAD e nel READ. Ciò contribuirà a migliorare la classificazione tumorale, a identificare nuovi biomarcatori epigenetici e potenziali target terapeutici, promuovendo approcci di medicina personalizzata per i pazienti affetti da CRC.